教程简介

欢迎来到CASSIA教程部分。在这里，我们提供基于真实数据的分步教程，帮助您全面了解CASSIA的完整工作流程和功能。

可用教程

我们的教程按复杂程度递增排列：

1. 使用标记文件进行基础注释 - 学习如何在已有标记基因的情况下使用CASSIA对细胞簇进行注释。

2. 使用可选代理的扩展分析 - 学习如何使用CASSIA的可选代理功能。

3. 从原始Seurat对象开始的聚类和注释 - 完整演示scRNA-seq数据的聚类和使用CASSIA进行细胞类型注释的流程。

开始之前

为了充分利用这些教程，请确保您已完成以下准备：

1. 正确安装CASSIA（参见安装配置）
2. 具备R编程基础
3. 熟悉单细胞RNA测序概念和Seurat

如果您对新增教程或改进现有教程有任何建议，欢迎通过我们的GitHub仓库贡献或联系开发团队。